巴州区以推广循环农业、节约农业为切入点，拓展农业废弃物资源化利用渠道，通过变废为宝，改善农业生态环境，提高农业比较效益。
一是肥料化，将作物秸秆、生活垃圾、畜禽粪便提供给企业作原料生产有机肥料，或者经无害化处理并腐熟后直接作有机肥施用，保护区年增施农业废弃物原料有机肥推广面积30万亩以上，增强土壤肥力，提高地力等级，改善农产品品质;二是饲料化，将作物秸秆通过微生物发酵，制成动物饲料，2年内新发展大中型养殖场6家以上;三是能源化，年修建大型、户用沼气设施1000口，以作物秸秆、畜禽粪便为原料生产沼气，为饮用水源保护区用户提供清洁能源，减少环境污染;四是基料化，以作物秸秆和畜禽粪便为基料，通过智能化、园区化、工厂化生产，发展食用菌生产面积10万平方米，大量消化农业废弃物。
