然而随着施密特年龄增长并于2003年退役后,巴西篮球开始走下坡路。2000-2008年,他们连续三届未能晋级奥运会,在2006年世锦赛和2007年美洲锦标赛上也遭遇惨败。
随着战绩和受关注度的下降,巴西男篮联赛陷入混乱,掌管联赛巴西篮协腐败丑闻频出,缺乏自主权的俱乐部经营也每况愈下。2004年的联赛甚至被称为“公交车联赛”,因为俱乐部付不起交通费用,球员需要坐公交去赛场。
2007年,美职篮丹佛掘金队的巴西大前锋内内曾拒绝为国出战,因为巴西国内的篮球环境让他心寒。“巴西的篮球是分裂的,球队正在消失,他们甚至不给球员支付工资。球迷也正从赛场上消失,而且主办方也都不可靠,”内内当时说。
2008年,巴西篮球界终于决心改革,重整资源创建了NBB(新巴西篮球联赛),效仿美职篮模式,NBB完全由参赛俱乐部自己管理,巴西篮协只起辅助作用。2011年,巴西篮坛又开设了LDB(巴西发展联赛),旨在培养22岁以下篮球运动员。
NBB的新闻官吉列尔梅·布索对新华社记者说,在创立NBB之后,巴西篮球联赛又逐渐走上正轨,有更多自主权的俱乐部运行更加平稳,赛事水平逐年提升。许多当年因对巴西联赛环境不满而去美国或者欧洲打球的巴西球员,都选择回归本土联赛。巴西发展联赛的创立,也让巴西篮球的青训体系得以完善,从该联赛走出的球员有的直接参加了美职篮选秀。