内蒙古科研团队构建完成发育时空调控数据库-世界快资讯

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近日，内蒙古大学教授左永春团队在哺乳动物早期胚胎发育的生物信息学研究领域取得了重要科研进展，相关成果以“EmAtlas：探索哺乳动物胚胎发生时空激活的综合地图集”为题，发表于国际著名出版集团牛津大学出版社旗下学术期刊《核酸研究》。

科研团队利用生物信息学和计算生物学方法创建完成了包含64TB的胚胎发育多组学时空调控图谱数据库与分析云平台EmAtlas。左永春介绍，科研团队利用Nextflow（并行多组学自动化分析管理系统），完成了基于12种前沿测序技术产生的821个数据集，共涉及人、小鼠等物种的9113个样本的生物信息学挖掘。随后将这些数据根据植入前胚胎、胎儿、新生儿的时空发育顺序进行归档整理，共包含65个不同发育时间点的组织类型和116种细胞类型。此外，23个国内外权威功能知识库的发育相关注释也被人工审编并整合到该数据库。围绕哺乳动物胚胎生长发育的全链条，该数据库还可实现从胚胎发育的两个尺度（时序、空间），宏观到微观的五个维度（组织、细胞、基因组、基因、蛋白质）解析哺乳动物早期发育进程。

据悉，该数据库的建成，将为从事哺乳动物发育领域的研究人员和临床医师提供有力的分析手段，并为人类新生儿遗传疾病、干细胞医疗、辅助生殖等优生优育手段提供专业的大数据精准医学分析服务，也为优良家畜保种育种等繁育工作提供新的研究思路。（记者白莲）